Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtskP55097 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtskP55097 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtskP55097 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtskP55097 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtskP55097 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtskP55097 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtskP55097 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtskP55097 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtskP55097 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtskP55097 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtskP55097 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtskP55097 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtskP55097 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtskP55097 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtskP55097 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtskP55097 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtskP55097 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtskP55097 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtskP55097 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtskP55097 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtskP55097 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtskP55097 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtskP55097 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtskP55097 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtskP55097 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtskP55097 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtskP55097 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtskP55097 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtskP55097 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtskP55097 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtskP55097 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtskP55097 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtskP55097 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CtskP55097 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CtskP55097 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtskP55097 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtskP55097 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtskP55097 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtskP55097 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtskP55097 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtskP55097 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtskP55097 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtskP55097 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtskP55097 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtskP55097 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtskP55097 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtskP55097 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtskP55097 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtskP55097 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtskP55097 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtskP55097 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtskP55097 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtskP55097 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtskP55097 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CtskP55097 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtskP55097 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtskP55097 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtskP55097 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtskP55097 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CtskP55097 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtskP55097 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtskP55097 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtskP55097 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtskP55097 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtskP55097 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtskP55097 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtskP55097 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtskP55097 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtskP55097 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtskP55097 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtskP55097 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtskP55097 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtskP55097 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtskP55097 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtskP55097 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtskP55097 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtskP55097 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtskP55097 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtskP55097 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CtskP55097 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtskP55097 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtskP55097 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtskP55097 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtskP55097 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtskP55097 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CtskP55097 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtskP55097 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtskP55097 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtskP55097 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtskP55097 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtskP55097 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtskP55097 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtskP55097 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtskP55097 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtskP55097 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtskP55097 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtskP55097 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtskP55097 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtskP55097 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms