Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aqp4P55088 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms