Protein–RNA interactions for Protein: P55012

Slc12a2, Solute carrier family 12 member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a2P55012 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc12a2P55012 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc12a2P55012 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc12a2P55012 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc12a2P55012 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc12a2P55012 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc12a2P55012 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc12a2P55012 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc12a2P55012 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc12a2P55012 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc12a2P55012 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc12a2P55012 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a2P55012 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms