Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acod1P54987 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acod1P54987 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acod1P54987 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acod1P54987 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Acod1P54987 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acod1P54987 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acod1P54987 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Acod1P54987 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Acod1P54987 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms