Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb4P54761 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ephb4P54761 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms