Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb3P54754 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms