Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nub1P54729 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nub1P54729 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nub1P54729 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nub1P54729 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nub1P54729 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nub1P54729 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nub1P54729 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nub1P54729 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nub1P54729 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nub1P54729 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nub1P54729 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nub1P54729 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms