Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacnb3P54285 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacnb3P54285 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms