Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fgf9P54130 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms