Protein–RNA interactions for Protein: P53986

Slc16a1, Monocarboxylate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a1P53986 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc16a1P53986 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc16a1P53986 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc16a1P53986 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a1P53986 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc16a1P53986 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc16a1P53986 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms