Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efnb1P52795 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms