Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2e3P52483 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube2e3P52483 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms