Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CastP51125 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CastP51125 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CastP51125 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CastP51125 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CastP51125 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CastP51125 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CastP51125 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CastP51125 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CastP51125 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CastP51125 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CastP51125 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CastP51125 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CastP51125 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CastP51125 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CastP51125 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CastP51125 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CastP51125 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CastP51125 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CastP51125 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CastP51125 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CastP51125 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CastP51125 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CastP51125 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CastP51125 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CastP51125 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CastP51125 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CastP51125 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CastP51125 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CastP51125 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CastP51125 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CastP51125 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CastP51125 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CastP51125 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CastP51125 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CastP51125 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CastP51125 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CastP51125 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CastP51125 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CastP51125 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CastP51125 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CastP51125 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CastP51125 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CastP51125 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CastP51125 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CastP51125 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CastP51125 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CastP51125 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CastP51125 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CastP51125 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CastP51125 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CastP51125 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CastP51125 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CastP51125 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CastP51125 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CastP51125 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CastP51125 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CastP51125 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CastP51125 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CastP51125 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CastP51125 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CastP51125 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CastP51125 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CastP51125 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CastP51125 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CastP51125 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CastP51125 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CastP51125 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CastP51125 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CastP51125 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CastP51125 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CastP51125 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CastP51125 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CastP51125 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CastP51125 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CastP51125 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CastP51125 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CastP51125 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CastP51125 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CastP51125 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CastP51125 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CastP51125 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CastP51125 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CastP51125 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CastP51125 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CastP51125 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CastP51125 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CastP51125 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CastP51125 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CastP51125 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CastP51125 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CastP51125 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CastP51125 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CastP51125 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CastP51125 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CastP51125 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CastP51125 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CastP51125 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CastP51125 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CastP51125 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms