Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FmodP50608 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FmodP50608 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FmodP50608 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FmodP50608 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FmodP50608 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FmodP50608 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FmodP50608 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FmodP50608 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FmodP50608 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FmodP50608 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FmodP50608 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FmodP50608 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FmodP50608 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FmodP50608 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FmodP50608 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FmodP50608 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FmodP50608 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FmodP50608 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FmodP50608 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FmodP50608 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FmodP50608 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FmodP50608 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FmodP50608 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FmodP50608 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FmodP50608 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FmodP50608 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FmodP50608 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FmodP50608 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FmodP50608 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FmodP50608 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FmodP50608 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FmodP50608 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FmodP50608 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FmodP50608 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FmodP50608 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FmodP50608 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FmodP50608 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FmodP50608 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FmodP50608 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FmodP50608 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FmodP50608 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FmodP50608 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FmodP50608 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FmodP50608 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FmodP50608 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FmodP50608 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FmodP50608 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FmodP50608 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FmodP50608 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FmodP50608 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FmodP50608 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FmodP50608 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FmodP50608 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FmodP50608 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FmodP50608 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FmodP50608 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FmodP50608 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FmodP50608 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FmodP50608 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FmodP50608 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FmodP50608 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FmodP50608 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FmodP50608 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FmodP50608 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FmodP50608 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FmodP50608 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FmodP50608 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FmodP50608 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FmodP50608 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FmodP50608 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FmodP50608 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FmodP50608 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FmodP50608 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FmodP50608 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FmodP50608 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FmodP50608 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FmodP50608 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FmodP50608 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FmodP50608 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FmodP50608 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FmodP50608 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FmodP50608 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FmodP50608 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FmodP50608 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms