Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdk5P49615 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk5P49615 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms