Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpreP49446 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpreP49446 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpreP49446 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpreP49446 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpreP49446 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpreP49446 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpreP49446 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpreP49446 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpreP49446 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpreP49446 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpreP49446 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpreP49446 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpreP49446 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpreP49446 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpreP49446 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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