Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni3P48787 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnni3P48787 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnni3P48787 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms