Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox8bP48772 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox8bP48772 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox8bP48772 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox8bP48772 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox8bP48772 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox8bP48772 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox8bP48772 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox8bP48772 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox8bP48772 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox8bP48772 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox8bP48772 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox8bP48772 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox8bP48772 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox8bP48772 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox8bP48772 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox8bP48772 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox8bP48772 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox8bP48772 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cox8bP48772 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox8bP48772 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cox8bP48772 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox8bP48772 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox8bP48772 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox8bP48772 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox8bP48772 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox8bP48772 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox8bP48772 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox8bP48772 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox8bP48772 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox8bP48772 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox8bP48772 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox8bP48772 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox8bP48772 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox8bP48772 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox8bP48772 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cox8bP48772 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox8bP48772 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox8bP48772 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox8bP48772 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox8bP48772 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox8bP48772 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox8bP48772 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox8bP48772 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox8bP48772 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox8bP48772 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox8bP48772 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox8bP48772 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox8bP48772 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox8bP48772 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox8bP48772 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms