Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx1P48377 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms