Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VdrP48281 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VdrP48281 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VdrP48281 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VdrP48281 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VdrP48281 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VdrP48281 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VdrP48281 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VdrP48281 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VdrP48281 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VdrP48281 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VdrP48281 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VdrP48281 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VdrP48281 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VdrP48281 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VdrP48281 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VdrP48281 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VdrP48281 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VdrP48281 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VdrP48281 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VdrP48281 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VdrP48281 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VdrP48281 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VdrP48281 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VdrP48281 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VdrP48281 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VdrP48281 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VdrP48281 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VdrP48281 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VdrP48281 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VdrP48281 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VdrP48281 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VdrP48281 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VdrP48281 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VdrP48281 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VdrP48281 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VdrP48281 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VdrP48281 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VdrP48281 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VdrP48281 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VdrP48281 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VdrP48281 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VdrP48281 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VdrP48281 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VdrP48281 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VdrP48281 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VdrP48281 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VdrP48281 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VdrP48281 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VdrP48281 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VdrP48281 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VdrP48281 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VdrP48281 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VdrP48281 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VdrP48281 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VdrP48281 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VdrP48281 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VdrP48281 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VdrP48281 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VdrP48281 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VdrP48281 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VdrP48281 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VdrP48281 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VdrP48281 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VdrP48281 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VdrP48281 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VdrP48281 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VdrP48281 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VdrP48281 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VdrP48281 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VdrP48281 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VdrP48281 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VdrP48281 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VdrP48281 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VdrP48281 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VdrP48281 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VdrP48281 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VdrP48281 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VdrP48281 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VdrP48281 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VdrP48281 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VdrP48281 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VdrP48281 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VdrP48281 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VdrP48281 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VdrP48281 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VdrP48281 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VdrP48281 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VdrP48281 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VdrP48281 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VdrP48281 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VdrP48281 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VdrP48281 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VdrP48281 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VdrP48281 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VdrP48281 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VdrP48281 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VdrP48281 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VdrP48281 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
VdrP48281 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms