Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl13P47963 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms