Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PfkmP47857 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PfkmP47857 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PfkmP47857 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PfkmP47857 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfkmP47857 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PfkmP47857 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PfkmP47857 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfkmP47857 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfkmP47857 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfkmP47857 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PfkmP47857 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfkmP47857 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfkmP47857 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms