Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrprbP47758 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrprbP47758 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrprbP47758 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrprbP47758 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SrprbP47758 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrprbP47758 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrprbP47758 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrprbP47758 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SrprbP47758 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SrprbP47758 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SrprbP47758 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms