Protein–RNA interactions for Protein: P47741

Tnfrsf4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf4P47741 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tnfrsf4P47741 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf4P47741 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf4P47741 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf4P47741 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms