Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic1P46684 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic1P46684 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zic1P46684 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic1P46684 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic1P46684 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic1P46684 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zic1P46684 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zic1P46684 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms