Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnfsf4P43488 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf4P43488 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms