Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr3P43300 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr3P43300 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr3P43300 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr3P43300 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Egr3P43300 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Egr3P43300 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Egr3P43300 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Egr3P43300 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Egr3P43300 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms