Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2f2P43135 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2f2P43135 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms