Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtgfrP43117 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtgfrP43117 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms