Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gdf5P43027 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdf5P43027 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms