Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3caP42337 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3caP42337 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3caP42337 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3caP42337 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3caP42337 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3caP42337 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3caP42337 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3caP42337 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3caP42337 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3caP42337 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3caP42337 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pik3caP42337 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms