Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sept1P42209 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sept1P42209 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sept1P42209 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sept1P42209 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sept1P42209 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sept1P42209 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sept1P42209 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sept1P42209 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sept1P42209 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sept1P42209 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sept1P42209 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sept1P42209 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sept1P42209 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sept1P42209 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sept1P42209 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sept1P42209 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sept1P42209 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms