Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cap1P40124 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cap1P40124 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cap1P40124 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cap1P40124 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cap1P40124 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cap1P40124 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cap1P40124 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cap1P40124 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cap1P40124 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cap1P40124 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cap1P40124 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cap1P40124 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cap1P40124 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms