Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timp3P39876 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timp3P39876 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timp3P39876 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Timp3P39876 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Timp3P39876 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Timp3P39876 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms