Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PtprkP35822 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PtprkP35822 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PtprkP35822 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PtprkP35822 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PtprkP35822 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PtprkP35822 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PtprkP35822 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PtprkP35822 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtprkP35822 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms