Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox5P35710 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox5P35710 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox5P35710 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox5P35710 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox5P35710 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox5P35710 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox5P35710 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox5P35710 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox5P35710 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox5P35710 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms