Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfc1P35601 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms