Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd22P35329 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd22P35329 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd22P35329 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd22P35329 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd22P35329 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cd22P35329 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd22P35329 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms