Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab20P35295 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab20P35295 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab20P35295 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab20P35295 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms