Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stfa1P35175 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa1P35175 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa1P35175 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa1P35175 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa1P35175 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa1P35175 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa1P35175 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa1P35175 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stfa1P35175 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stfa1P35175 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stfa1P35175 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms