Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptk2P34152 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms