Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms