Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa2P31245 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms