Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Col2a1P28481 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 251.8 ms