Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa5P28312 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa5P28312 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa5P28312 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa5P28312 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa5P28312 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa5P28312 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms