Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aco1P28271 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aco1P28271 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aco1P28271 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aco1P28271 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aco1P28271 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Aco1P28271 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aco1P28271 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aco1P28271 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aco1P28271 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aco1P28271 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aco1P28271 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms