Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb1P28230 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms