Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjc1P28229 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms