Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb7P26011 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb7P26011 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb7P26011 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms