Protein–RNA interactions for Protein: P25446

Fas, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FasP25446 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FasP25446 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FasP25446 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FasP25446 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FasP25446 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FasP25446 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FasP25446 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FasP25446 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FasP25446 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FasP25446 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FasP25446 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FasP25446 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FasP25446 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FasP25446 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FasP25446 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FasP25446 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FasP25446 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FasP25446 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FasP25446 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FasP25446 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FasP25446 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FasP25446 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FasP25446 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FasP25446 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FasP25446 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FasP25446 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FasP25446 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FasP25446 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FasP25446 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FasP25446 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FasP25446 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FasP25446 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FasP25446 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FasP25446 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FasP25446 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FasP25446 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FasP25446 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FasP25446 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FasP25446 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FasP25446 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FasP25446 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FasP25446 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FasP25446 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FasP25446 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FasP25446 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FasP25446 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FasP25446 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FasP25446 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FasP25446 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FasP25446 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FasP25446 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FasP25446 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FasP25446 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FasP25446 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FasP25446 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FasP25446 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FasP25446 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FasP25446 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FasP25446 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FasP25446 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FasP25446 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FasP25446 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FasP25446 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FasP25446 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FasP25446 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FasP25446 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FasP25446 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FasP25446 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FasP25446 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FasP25446 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FasP25446 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FasP25446 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FasP25446 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FasP25446 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FasP25446 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FasP25446 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FasP25446 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FasP25446 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FasP25446 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FasP25446 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FasP25446 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FasP25446 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FasP25446 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FasP25446 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FasP25446 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FasP25446 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FasP25446 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FasP25446 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FasP25446 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FasP25446 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FasP25446 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FasP25446 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FasP25446 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FasP25446 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FasP25446 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FasP25446 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FasP25446 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FasP25446 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FasP25446 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FasP25446 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms